自然水体的自净过程主要包括物理净化、化学净化和生物净化三个方面。
1. 物理净化：是指通过水流的冲刷、稀释扩散等作用，使得污染物浓度降低的过程。此外，悬浮物质在水中由于重力的作用会逐渐沉降到水底，这也是物理净化的一种方式。
2. 化学净化：主要指污染物在自然水体中发生氧化还原反应、酸碱中和反应、沉淀反应以及光化学反应等一系列过程，从而减少有毒有害物质的含量。例如，重金属离子可以通过与某些阴离子结合形成难溶化合物而从水中去除；有机物则可能被微生物分解为二氧化碳和水。
3. 生物净化：是指在自然水体中存在的各种生物（如细菌、藻类等）通过新陈代谢活动对污染物进行降解转化的过程。微生物特别是异养菌，能够将复杂的有机物质逐步分解成简单的无机化合物；而浮游植物则可以通过光合作用吸收水中的营养盐分，并释放氧气，改善水质条件。

这三个过程相互作用，共同完成了自然水体的自净功能。然而需要注意的是，虽然自然水体具有一定的自我修复能力，但当污染负荷超过其承受范围时，这种自净能力就会受到严重破坏，导致水质恶化。因此，在日常生活中我们应当采取有效措施保护水资源，减少对环境的污染。