配对设计四格表资料主要适用于两种情况：
1. 同一样本在不同条件下或同一样本接受两种处理后的二分类结果比较。比如，研究某种治疗方法的效果时，可以观察同一批患者治疗前和治疗后的情况变化。
2. 配对的两个样本之间的二分类结果比较。例如，在病例对照研究中，每个病例都与一个或多个具有相似特征但未患病的人（对照组）进行配对，以探讨某因素是否为疾病的危险因素。
适用条件包括：
- 数据必须是配对的：即每一对数据之间存在一定的关联性，如来自同一个体、同一时间点等。
- 结果变量应为二分类资料：例如阳性/阴性、发生/未发生等。
- 样本量不宜过小：虽然没有严格的规定，但一般认为样本量至少需要达到30对以上才能保证统计检验的有效性和可靠性。当样本量较小时，可能需要考虑使用Fisher确切概率法来代替卡方检验。
在具体分析时，还需要注意数据是否符合卡方检验的假设条件（如期望频数分布等），以选择合适的统计方法进行处理。
