构成核酸的主要碱基有五种，分别是腺嘌呤（Adenine, A）、鸟嘌呤（Guanine, G）、胞嘧啶（Cytosine, C）、胸腺嘧啶（Thymine, T）和尿嘧啶（Uracil, U）。在DNA中，我们通常会看到的是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶这四种碱基。而在RNA中，则是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶这四种。
这些碱基通过与五碳糖（脱氧核糖在DNA中，核糖在RNA中）以及磷酸基团结合形成核苷酸，而核苷酸之间则通过磷酸二酯键相连，构成了核酸的长链结构。腺嘌呤和鸟嘌呤属于双环结构的嘌呤类碱基，而胞嘧啶、胸腺嘧啶及尿嘧啶则为单环结构的嘧啶类碱基。
在DNA分子中，腺嘌呤总是与胸腺嘧啶配对，形成两个氢键；鸟嘌呤则总是与胞嘧啶配对，形成三个氢键。而在RNA分子中，由于没有胸腺嘧啶而是尿嘧啶的存在，所以腺嘌呤与尿嘧啶配对，同样通过两个氢键连接；而鸟嘌呤和胞嘧啶之间的配对规则不变。
这些碱基的特定排列顺序携带着遗传信息，并指导着生物体内的蛋白质合成过程。因此，理解核酸中不同类型的碱基对于研究基因表达、遗传变异以及分子生物学等领域至关重要。
