免疫系统通过一系列复杂而精确的机制来识别和攻击细菌，这一过程可以大致分为非特异性免疫反应（先天性免疫）和特异性免疫反应（适应性免疫）两个阶段。

首先，在非特异性免疫反应中，当细菌进入人体后，它们会遇到作为第一道防线的物理屏障如皮肤、黏膜等。如果这些屏障被突破，体内的吞噬细胞如巨噬细胞和中性粒细胞便会被激活。这类细胞能够通过表面受体识别细菌上的特定分子模式（PAMPs），例如脂多糖或肽聚糖，这些是大多数病原微生物所共有的成分但正常人体组织却没有的。一旦被识别到，吞噬细胞就会将细菌吞入胞内，并在溶酶体内将其分解消灭。

接下来，在特异性免疫反应中，如果初次防御未能完全清除入侵者，则需要启动更精准的适应性免疫应答。抗原呈递细胞（APCs），如巨噬细胞和树突状细胞，会处理并展示细菌抗原给T淋巴细胞。这导致了两个主要的结果：一是辅助T细胞被激活，它们可以分泌多种细胞因子以增强其他免疫细胞的功能；二是B淋巴细胞受到刺激后分化成为浆细胞，产生特异性抗体来中和或标记细菌以便进一步清除。

此外，在适应性免疫过程中形成的记忆细胞能够在再次遇到相同病原体时迅速做出反应，提供长期保护作用。整个过程涉及多种细胞、分子及信号通路的协同工作，确保机体能够有效地抵御细菌感染。