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有机物在微生物的作用下分解成为简单的化合物的同时，又重新合成复杂的高分子化合物，称为腐殖质。腐殖质是一种质地疏松、暗褐色的、含氮量很高的有机化合物，它的成分很复杂，其中含有木质素、蛋白质、碳水化合物、脂肪和腐殖酸（如胡敏酸、富里酸等）。腐殖质化学性质稳定，病原菌已经死灭，卫生上是安全的，不招苍蝇，没有不良臭味，有机物达到了理想的无害化程度。腐殖质又是理想的农业肥料。所以，人工堆肥法处理有机污染物，就是使大量有机污染物在短时间内转化为腐殖质而达到无害化的目的。