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1、直接病因
在病因链或病因网中。所有与疾病发生直接相关的病因称为直接病因，对应于疾病因素模式中的近因。
2、间接病因
其他与疾病间接相关的致病因素称为间接病因，对应于疾病因素模式中的远因。
例如，在病因链“静脉注射吸毒→共同使用注射器→注射器污染HIV→病毒感染→艾滋病发作”之中，HIV感染称为直接病因，而它以前的因素都称为间接病因。另外，这里直接与间接的区别只是相对的；如在上述病因链中，HIV感染与艾滋病发作之间还可以插入CD4+ T细胞被破坏这个中间因素，HIV感染则成了间接病因。
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