目前认为光疗相当安全，虽有副作用，但一般无危险。

　　1.发热  为最常见现象之一，体温常达38～39℃，亦有在39℃以上者，这是由于荧光灯的热能所致。

　　2.腹泻  亦为常见，大便稀薄呈绿色，每日4～5次，最早于光疗3～4h即可出现，但光疗结束后不久即停止，其主要原因是，光疗分解产物经肠道排除时刺激肠壁引起。稀便可使体液减少，应注意适当补充水分。

　　3.皮疹  有时会出现斑点皮疹，有时为淤点，可持续到光疗结束，这在血清胆红素高的情况下经常见到，常分布于面部、下肢、躯干，消退后不留痕迹，原因不明。

　　4.黄素缺乏与溶血  光疗超过24h，可以造成机体内核黄素缺乏，核黄素吸收高峰在450nm这正是蓝光对胆红素起作用的最大光谱。因此胆红素与核黄素同时分解，造成核黄素缺乏。由于核黄素水平降低，影响了黄素腺嘌吟二核苷酸（FDA）的合成，导致红细胞（GR是以FDA为辅酶的黄素蛋白酶），可使溶血加重。已有报道证实光疗使红细胞（GR）活性下降，溶血加剧。光疗同时和光疗后短期补充核黄素可防止继发于红细胞（GR）活性降低所致的溶血。光疗时核黄素剂量5mg，每天3次，直到光疗结束，改为每日1次，连服3d。

　　5.青铜症  青铜症的原因可能是由于胆汁郁积，照光后阻止了胆管对胆红素光氧化产物的排泄。光疗并不损害肝功能。当光疗停止后，青铜症可以逐渐消退，但时间较长。

　　6.低血钙  光疗可引起低血钙的发生，但一般并无临床症状，只要使用钙剂或者停止光疗，低钙一般可以得到恢复，值得注意的是低钙严重者可以引起呼吸暂停、抽搐、青紫甚至危及生命。

　　7.其他  对多组经光疗的小儿随访结果表明，对生长发育无不良影响，但由于强的光线照射，可能对眼有一定危害（充血、角膜溃疡等），故光疗时必须用黑纸或黑布保护眼睛，只要做好保护，并无影响。