中医采用辨证施治的方法治疗肛瘘，取得了一定疗效。总结分型如下：
①湿热蕴结：肛门肿痛、下坠，漏出黄白稠厚的脓液，脓量多而且臭，大便不畅，小便短赤；舌苔黄腻，脉洪大滑数。甚则身热恶寒，口渴不欲饮。
治则：清热利湿，解毒。
方药：三黄泻心汤或黄连除湿汤加减。
②阴虚热蒸：症见肛门肿痛，下坠，下漏脓液清稀，色白如豆渣，淋漓不尽，大便秘结或溏泻，午后潮热，食少乏味，盗汗失眠；舌红少津，脉细数。也有兼有贫血。
治则：滋阴清热。
方药：青蒿鳖甲汤加减。
③气滞血瘀：症见：肛门肿痛，隆起，坚硬如石，漏下脓血污水，如果冻状，恶臭异常，兼见消瘦、乏力、食少；脉弦，舌暗紫有瘀斑。
治则：补气养血，清热利湿。
方药：补中益气汤合三黄泻心汤加减。
