肛门裂病人的典型临床表现有疼痛、便秘和便血。
疼痛：肛门裂可因排粪引起周期性疼痛，这是肛门裂的主要症状。排粪时，粪块刺激溃疡面的神经末梢，立刻感到肛门的灼痛，但便后数分钟疼痛缓解，此期称疼痛间歇期。以后因内括约肌痉挛，又产生剧痛，此期可持续半小时至数小时，使病员坐立不安，很难忍受，直至括约肌疲劳后，肌肉松弛，疼痛缓解。但再次排便，又发生疼痛。以上临床称为肛门裂疼痛周期。疼痛还可放射到会阴部、臀部、大腿内侧或骶尾部。
便秘：此为肛门裂的病因，又是肛门裂的后果。肛门裂后病人因肛门疼痛不愿排便，久而久之引起便秘，粪便更为干硬，便秘又可使肛门裂加重，形成恶性循环，使肛门裂难以愈合。
便血：排便时常在粪便表面或便纸上见有少量新鲜血迹，或滴鲜血。大出血少见。
其他：如肛门瘙痒、分泌物、腹泻等。是由于肛门裂溃疡的分泌物或并发的肛隐窝炎、肛乳头炎等所产生的分泌物的刺激，引起肛门瘙痒（表1）。
体征：国外曾报道355例肛门裂有下列不同体征：肛管痉挛78%，前哨痔68%，肥大乳头25%，肛瘘6%，括约肌间脓肿4%，痔38%，肛管狭窄2%。
