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脑干出血的后遗症，会有深度昏迷、植物状态、肢体功能受限、感觉受限、语言障碍、电解质紊乱、酸中毒、脑水肿等。
脑干出血的病死率还是非常高的，70岁以上的老年患者病死率可达70%以上，年龄越小一些，病死率相对会下降。脑干出血的病情发展迅速，并且颅内压增高症状的出现的时间比较早，对于没有死亡的患者的后遗症是比较严重的。如果患者出现肢体功能障碍的话，要进行系统康复训练。语言、吞咽功能下降，需要进行相应针对性康复训练，有的患者可伴有认知功能的下降也需要进行认知功能的训练。要注意脑干出血昏迷时间长了，可能会导致患者的肢体、关节、肌肉韧带等出现了僵化、萎缩、松弛的现象，都属于康复训练的范畴。对于深度昏迷的患者必须维持生命体征、防止肺部感染和泌尿系感染，为避免褥疮的发生要定时给患者翻身。
脑干出血的后遗症，大多数情况下是比较严重的，所以一方面是等待血肿的吸收，另一方面要进行患者后遗症的针对性治疗，如康复训练，还要积极治疗原发病。
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