沙眼的病程可延续数年或数十年。在这冗长的过程中，很多并发症及后遗症可能出现，包括睑下垂、睑内翻、倒睫、角膜混浊及溃疡、眼干燥病等，则出现明显刺激症状，并常引起视力障碍。

儿童沙眼常为急性发病，呈急性滤泡性结膜炎，耳前淋巴结肿大，颇难与病毒性急性滤泡性结膜炎鉴别。凡持续3周以上而不消退者，应考虑急性沙眼。可由实验室检查包涵体或分离培养衣原体而明确诊断。常见者为慢性炎症过程。除弥漫性脸结膜充血外，有乳头肥大，滤泡形成，瘢痕和角膜血管翳。

①乳头增生肥大，脸结膜充血、粗糙，呈天鹅绒状；

②滤泡形成多在上穹窿部，下睑及下穹窿部较少。滤泡大小不一，呈圆形、椭圆形或不规则形。胶状不透明，色暗红；

③瘢痕随时间进展，在充血肥厚的组织中出现灰白色线状、网状瘢痕。最后滤泡乳头的增殖完全消失，为瘢痕所代替，沙眼即告痊愈。

④角膜血管翳在沙眼早期就可出现，是沙眼的特有改变。在角膜上缘呈帘状由上而下伸入角膜透明区，新生血管翳位于角膜浅层，整齐地停止在同一水平线上。病程长血管翳可以从角膜缘各方向伸入，覆盖全角膜，影响视力。

沙眼的自觉症状轻微，痒、异物感、干燥感等。沙眼是我国主要致盲原因之一。切断传染途径，控制沙眼传播，主要在于预防。个人要养成良好卫生习惯，注意经常洗手，不用手揉眼，不用别人的毛巾等。对集体方面，应改善环境卫生，在托儿所、幼儿园要认真培养儿童卫生习惯，加强卫生宣传教育工作，检查发现并治疗已有沙眼的患儿。由于农村卫生条件较差，沙眼重复感染较多，后遗症随年龄递增，预防知识的传播更为重要。