氯己定抗菌斑的作用机制是：
①减少唾液中能吸附到牙面上的细菌数量;氯己定吸附到细菌表面，与细菌细胞壁的阴离子作用，增加了细胞壁的通透性，从而使氯己定容易进入细胞内，使胞质沉淀而杀灭细菌，从而使吸附到牙面上的细菌数量减少;
②氯己定与唾液酸性糖蛋白的酸性基团结合，从而封闭唾液糖蛋白的酸性基团，使唾液糖蛋白对牙面的吸附能力减弱、抑制获得性膜和菌斑的形成;
③氯己定与牙面釉质结合，覆盖牙面，因而阻碍了唾液细菌对牙面的吸附;
④氯己定与Ca2+竞争，而取代Ca2+与唾液中凝集细菌的酸性凝集因子作用，并使之沉淀，从而改变了菌斑细菌的内聚力，抑制细菌的聚积和对牙面的吸附。
