牙科器械灭菌的标准流程主要包括以下几个步骤：
1. 预处理：在每次使用后，应立即清除器械上的可见污物和血迹。可以使用流动水冲洗或者采用酶清洁剂浸泡等方法。
2. 清洁：将预处理后的器械放入超声波清洗器或手动刷洗以彻底去除残留物质。之后用清水充分漂洗干净，并干燥表面水分。
3. 包装与标记：将清洁并干燥的器械按照使用需求分类包装，通常采用专门设计的灭菌袋、盒或者托盘等容器。同时注明灭菌日期和失效期等相关信息。
4. 灭菌：选择合适的物理或化学方法进行灭菌处理。最常用的物理方法是高压蒸汽灭菌法；对于不耐热的材料，则可考虑使用环氧乙烷气体或其他低温化学消毒剂。
5. 监测与记录：每次灭菌过程中都应放置生物指示物（如芽孢条）以监测灭菌效果，并做好详细的记录工作，确保每批次器械均达到无菌状态。
6. 存储：经过验证合格的灭菌器械需存放在清洁、干燥、通风良好的环境中，避免再次污染。使用前检查包装是否完好以及有效期是否过期。

以上是牙科器械常规的灭菌流程，在实际操作中还需结合具体设备和材料特性来选择合适的步骤和技术参数。同时也要定期培训工作人员，确保他们熟悉并严格执行这些规范要求。