在进行根管治疗时，选择合适的药物是非常重要的一步。首先需要明确的是，在不同的治疗阶段，所使用的药物可能会有所不同，主要目的是消毒杀菌、促进愈合以及预防感染扩散等。
1. 根管预备阶段：此阶段主要是清除根管内的细菌和坏死组织，常用的药物有次氯酸钠溶液（3%-6%）、过氧化氢溶液（3%）等。这些药物具有较强的抗菌作用，能够有效去除根管内部的微生物及其产物，同时也有助于软化根管壁上的牙本质，便于后续操作。
2. 根管消毒阶段：在完成根管清理后，为了进一步确保根管内的无菌环境，通常会使用甲醛甲酚（FC）、戊二醛、氯己定等药物进行根管内封药。这些药物能够长时间保持其抗菌效果，有助于防止细菌再次感染。
3. 根管填充前：在正式封闭根管之前，有时还需要放置一些具有消炎镇痛作用的药物如氢氧化钙糊剂，它不仅可以持续发挥杀菌作用，还能够促进牙本质修复及新生组织形成。

需要注意的是，在选择具体药品时应考虑患者个体情况（比如过敏史）、病情特点等因素，并严格按照临床指南和医生的专业指导来进行。此外，随着医学研究的发展，新的材料和技术不断出现，治疗方案也会随之更新完善。因此，作为口腔主治医师，保持持续学习的态度，关注最新的研究成果对于提高诊疗水平至关重要。