在进行根管治疗的过程中，选用适当的消毒药物对于清除根管内的细菌和感染物质至关重要。常用的根管内消毒药物主要包括次氯酸钠（NaOCl）、过氧化氢（H2O2）以及氯己定等。
1. 次氯酸钠：是最常见的根管冲洗液之一，具有较强的杀菌作用，可以有效清除根管内的细菌和坏死组织。它还能够溶解有机物质，帮助清理根管壁上的玷污层，提高治疗效果。但使用时需要注意浓度控制，过高或过低的浓度都会影响其消毒效果，并可能对周围健康组织造成损伤。
2. 过氧化氢：也是一种有效的抗菌剂，尤其适合于清除次氯酸钠无法完全去除的生物膜。它通过释放氧气来破坏细菌细胞壁，达到杀菌的目的。不过需要注意的是，单独使用过氧化氢的效果不如与次氯酸钠联合应用时好，并且可能会产生泡沫影响视野。
3. 氯己定：具有广谱抗菌作用，能够长时间保持根管内的无菌状态，减少术后感染的风险。通常作为辅助性消毒药物，在完成主要的冲洗步骤后使用，以增强整体的消毒效果。

除了上述几种常用的消毒药物外，还有一些其他的化学物质如EDTA（乙二胺四乙酸）等也可以用于根管治疗过程中的消毒和清洁工作。在实际操作中，医生会根据患者的具体情况选择最合适的消毒方案，确保达到最佳的治疗效果。同时，在使用任何消毒剂之前都应充分了解其特性及可能产生的副作用，并严格按照规范进行操作。