胃肠功能的神经调节方式主要分为自主神经系统调节和肠神经系统调节两大部分。

自主神经系统又包括交感神经和副交感神经。交感神经兴奋时，其末梢释放去甲肾上腺素，会抑制胃肠运动和消化腺的分泌。例如在人体处于应激状态时，交感神经活动增强，胃肠蠕动减慢，消化液分泌减少，这样可以使更多的血液分配到心、脑、骨骼肌等重要器官，以应对紧急情况。副交感神经主要是迷走神经，其兴奋时末梢释放乙酰胆碱，能促进胃肠运动，使胃肠蠕动加快，还能促进消化腺的分泌，如促进胃液、胰液等的分泌，有助于食物的消化和吸收。比如在进食后，副交感神经活动相对增强，促进胃肠的消化和吸收功能。

肠神经系统是存在于胃肠道壁内的一套独立的神经系统，它包含了数以亿计的神经元。肠神经系统可以独立于中枢神经系统对胃肠功能进行局部调节。它能感受胃肠道内的机械、化学和温度等刺激，然后通过神经元之间的联系，调节胃肠道的运动、分泌和血流等。例如，当食物进入胃肠道后，肠神经系统可以感知到食物的存在和性质，然后调节胃肠道的蠕动速度和消化液的分泌量，以适应不同食物的消化需求。而且，肠神经系统还可以与自主神经系统相互协作，共同精确地调节胃肠功能，保证胃肠道正常的消化和吸收过程。