口腔流行病学的研究方法可以分为描述性流行病学、分析性流行病学和实验流行病学三大类。

描述性流行病学是流行病学中最常用的一种，它主要用于描述疾病或健康状况在人群中的分布情况。横断面研究是其中一种常见方法，它在特定时间内，对特定人群中的疾病或健康状况进行调查，比如在某一时刻对某学校学生的龋齿患病情况进行调查，以了解该人群口腔疾病的患病现状。纵向研究则是对一组人群进行较长时间的跟踪观察，以研究疾病的发展趋势，例如观察儿童从乳牙列到混合牙列过程中龋齿的发生发展情况。常规资料分析是对已有的记录资料进行分析，如医院的病历记录、疾病报告等，通过对这些资料的分析可以了解口腔疾病的流行规律。

分析性流行病学主要用于探讨病因和相关因素。病例 - 对照研究是选择患有某病的病例组和未患该病的对照组，比较两组在过去暴露于某种危险因素的比例，以判断该因素与疾病的关联程度，例如研究吸烟与牙周病的关系。队列研究是将人群按是否暴露于某因素分为暴露组和非暴露组，随访观察一定时间，比较两组疾病的发生率，从而验证该因素与疾病的因果关系，如观察长期使用某种含氟牙膏的人群与未使用人群的龋齿发病情况。

实验流行病学是将研究对象随机分为实验组和对照组，人为地给予实验组某种干预措施，对照组不给予或给予安慰剂，然后观察两组的结果差异，以评价干预措施的效果。例如在社区开展口腔健康教育项目，随机选择部分社区居民作为实验组进行口腔健康教育，另一部分作为对照组不进行干预，一段时间后比较两组居民的口腔健康知识和行为的改变情况。

这些研究方法各有特点和适用范围，在口腔流行病学研究中常常相互结合使用，以更全面、深入地了解口腔疾病的发生、发展和流行规律，为制定口腔疾病的防治策略提供科学依据。