口腔分子生物学是一门新兴的交叉学科，它主要运用分子生物学的理论和技术，从分子水平研究口腔组织器官的正常结构与功能，以及疾病发生、发展和防治的机制。

在口腔组织发育方面，口腔分子生物学研究牙胚发育过程中基因的表达调控和信号传导机制。例如，研究特定基因如何调控牙釉质、牙本质和牙髓的形成，了解这些过程有助于深入认识牙齿发育异常的原因，为先天性牙病的诊断和治疗提供理论基础。

在口腔疾病研究中，它聚焦于口腔肿瘤、牙周病、龋病等。对于口腔肿瘤，研究肿瘤细胞中的基因突变、基因表达变化以及信号通路的异常激活，有助于揭示肿瘤的发生发展机制，寻找新的诊断标志物和治疗靶点。在牙周病方面，探究细菌感染引发的宿主免疫反应和炎症信号传导途径，以及这些过程中涉及的分子机制，为牙周病的防治提供新的思路。对于龋病，研究致龋菌的致病机制，如细菌的黏附、产酸和耐酸能力等相关的分子基础，以及宿主的抗龋机制，有助于开发更有效的防龋措施。

此外，口腔分子生物学还在口腔组织再生和修复领域发挥重要作用。研究如何通过调控细胞的基因表达和信号传导，促进口腔组织的再生和修复，如牙体组织的修复和牙周组织的再生等。同时，在口腔疾病的基因诊断和基因治疗方面，通过检测特定基因的变化进行疾病的早期诊断，以及探索利用基因治疗技术治疗口腔疾病的可能性。