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酵母菌的生殖方式分无性繁殖和有性繁殖两大类。
无性繁殖包括:芽殖，裂殖，芽裂。
有性繁殖方式:子囊孢子。
芽殖:这是酵母菌进行无性繁殖的主要方式。成熟的酵母菌细胞，先长出一个小芽，芽细胞长到一定程度，脱离母细胞继续生长，而后形成新个体。有一端出芽、两端出芽、三端出芽和多端出芽。
裂殖:少数种类的酵母菌与细菌一样，借细胞横分裂而繁殖。
芽裂:母细胞总在一端出芽，并在芽基处形成隔膜，子细胞呈瓶状。这种方式很少。
子囊孢子:在营养状况不好时，一些可进行有性生殖的酵母会形成孢子(一般来说是四个)，在条件适合时再萌发。一些酵母，如假丝酵母(或称念珠菌，Candida)不能进行有性繁殖。
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