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诊断IgA肾病的关键检查是肾脏活检。通过肾脏组织的病理学检查，可以观察到典型的免疫复合物沉积特征，特别是以IgA为主的免疫球蛋白在肾小球系膜区的沉积。此外，血液和尿液检查也是重要的辅助手段，如血清肌酐、尿素氮水平测定以及24小时尿或尿蛋白定量等，这些可以帮助评估肾脏功能及损伤程度。但最终确诊仍需依赖于肾脏活检的结果。
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