不建议将本品与环孢霉素同时使用。一些健康受试者在接受两次剂量为3mg/kg的环孢霉素且同时使用本品治疗后，丙氨酸转氨酶(ALT)和天冬氨酸转氨酶(AST)出现不到或等于3倍正常上限(ULN)水平的一过性升高。但停药后又恢复正常。当本品与环孢霉素同时使用时，本品的曲线下面积(AUC)会增加大约35%；而血中环孢霉素的水平未改变。
[妊娠]
目前尚无有关妊娠妇女使用卡泊芬净的临床资料。在大鼠中，当给母鼠5mg/kg/天的申毒剂量时，卡泊芬净导致了胎鼠体重下降，并使头颅和躯干不完全骨化的发生率上升。
另外，在此剂量下,大鼠中颈肋的发生率升高。动物试验发现。卡泊芬净能穿过胎盘屏障。
除非一定必要，本品不得在妊娠期间使用。
[哺乳妇女]
尚不清楚本药物是否能由人类乳汁排出。因此接受本品治疗的妇女不应哺乳。
[儿童用药]
尚未在儿童病人中对醋酸卡泊芬净进行过研究。
不推荐18岁以下的病人使用本品。
[老年患者用药]
老年病人(65岁或以上)无需调整药物刑量。
与健康年轻男性相比，健康老年男性和女性(65岁或65岁以上)的血浆卡泊芬净浓度略有升高(AUC大约升高28%)。在感染真菌的病人中，年龄不是影响卡泊芬净药代动力学的主要决定因素。
