春末夏初，病菌在低温或中等温度而湿度较高时主要危害叶片，叶面有圆形或不规则形褐黄色斑，直径1～10毫米，背面集生黄色杯状小颗粒（病菌锈孢子器）。
(1) 玉竹锈病
防治方法：
① 可喷洒0.1～0．2波美度石硫合剂或20%粉锈宁2000倍液防治。
② 选用无病种条件作种或发现病株进行清除（少量病株）。
(2) 叶斑病
为真菌性病害，主要为害叶片。先从叶尖出现椭圆形或不规则形，边缘紫红，中间褐色的病斑，从病斑逐渐向下蔓延，使叶片成为淡白色，枯萎而死。多在夏秋开始发病，雨季发病较严重。
防治方法：
① 收获后及时清洁田园卫生，将枯枝病残体集中进行烧毁，消灭田园内越冬病原；
② 药剂防治在发病前及发病初期喷1：1：120波尔多液，或50%退菌特1000倍液，每10天喷1次，连续2--3次。
(3) 紫轮病
为真菌性病害，主要为害叶片。病斑生于叶两面，圆形至椭圆形，直径2--5mm，初期红色，后中央呈灰色至灰褐色，上生黑色小点，为病原菌的分生孢子器。
防治方法：
① 收获后彻底清洁田园，及时摘除病叶集中深埋或烧掉。
② 发病初期选用50%代森猛锌600倍液、70%甲基托布津800--1000倍液或 50%万霉灵500倍液等药剂喷雾，每15天喷1次，连续2--3次。
(4) 褐斑病
为真菌性病害，主要为害叶片。被害叶产生褐色病斑，常受叶脉所限呈条状，中央色淡，后期上生灰黑色霉状物。常造成叶片早枯，影响产量。氮肥施用过多、植株过密及田间湿度大有利于发病。
防治方法：
① 秋后彻底清洁田间病残体，集中深埋或烧掉；春季出苗前用硫酸铜250倍液喷施地面。
② 加强栽培管理，实行配方施肥，避免植株过于茂盛。
③ 发病早期及时剪除病部，并用1：1：150波尔多液保护；生长季用50%代森锰锌600倍液、70%甲基托布津800倍液或50%万霉灵500倍液等药剂交替使用，共喷2--3次。
(5) 蛴螬
防治方法：
① 在冬春季检查越冬场所，消灭成虫；
② 利用成虫假死性进行人工捕杀；
③ 避免与马铃薯地邻作；
④ 药剂防治：用90%敌百虫晶体，或50%杀螟松乳油1000倍液喷雾。
