制霉菌素与另一重要的抗霉菌抗生素──两性霉素（庐山霉素）──结构类似。药用的产品主要为制霉菌素A1, 此外还含有少量的A2和A3。性状淡黄色或浅褐色粉末；有引湿性，有谷物香味。性质不稳定，极微溶于水，略溶于乙醇、甲醇，较易溶于脂类基质。暴露在热、光、空气或潮湿状态下会变质。在微碱性介质中稳定，pH值9～12时不稳定。多聚醛制霉菌素钠盐可溶于水。
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