彩色马铃薯有紫色、红色、黑色、黄色马铃薯。 彩色马铃薯还可作为特色食品开发。由于本身含有抗氧化成分，因此经高温油炸后彩薯片仍保持着天然颜色。另外，紫色马铃薯对光不敏感，油炸薯片可长时间保持原色。
目前中国已培育出以紫色、红色为主的彩色优质马铃薯，将紫、红色马铃薯老品种与优良高产马铃薯品种杂交，改良筛选出100多份不同品系的彩色马铃薯。与老品种相比，改良后彩色马铃薯芽眼小，外观好看，抗病性强，亩产可达到1000至1500公斤。该研发中心还准备培育蓝色马铃薯品种。
据农业专家初步分析，黑色马铃薯之所以呈现黑紫色，是因为其含有大量的花菁素，而花菁素具有抗衰老作用。同时，还具有主秆发达、分枝少、生长势强、抗病性强的特点，亩产达1500公斤，比普通马铃薯品种增产20%左右。同时，由于该品种抗病性的提高，在生产中大大降低了农药的使用剂量，有利于生产出无污染、无公害的绿色食品。
