人毛滴虫与阴道毛滴虫形态相似，但波动膜和基染色杆较长，直至虫体后端；后鞭毛在波动膜左侧并行在虫体后端伸出体外，伪足形成较少见，在不适宜环境中可形成假包囊。虫体通过吞饮吞噬等获取营养。滋养体寄生在人结肠并以纵二分裂法繁殖。滋养体随腹泻便排出，在室温下可存活8天；土壤中可存活7天。人因食入被滋养体污染的食物或饮水而感染，也可由苍蝇等传播健康搜索。本病在热带和亚热带地区较为常见，尤其卫生条件差的地区感染率更高。儿童多于成人，10岁以下的儿童更为多见。感染率各地不同。我国曾调查抚顺北京上海台北、汉中阆中兰州等地感染率0.2%～9.4%。近年调查济南为0.5%，太原0.15%，承德0.2%。美国大学生0.16%，农村居民0.3%,新奥尔良门诊患者1.2%；哥伦比亚2.0%～13.5%；新几内亚4.7%；墨西哥儿童21.3%；前南斯拉夫8～10岁小学生40%。小鼠动物模型研究表明人毛滴虫可引起肠黏膜充血水肿与炎症反应，黏膜上皮细胞坏死脱落淋巴滤泡小脓肿形成当宿主抵抗力下降时，在肠道共生细菌存在下，虫体大量繁殖，黏膜损害明显加重，腹泻次数增多，毛滴虫的活跃运动造成强烈的机械刺激，引起腺体分泌亢进虫体具有较多的溶酶体内含丰富的酸性磷酸酶等水解酶。大量虫体释放的溶酶体酶可使肠黏膜上皮细胞变性坏死出现腹泻。
