有关本症的发病机制，迄今还没有统一的认识。精神因素在本症的发生和发展中起重要的作用，如有过度劳累、情绪紧张、家庭纠纷、生活和工作上的困难等，若长期得不到合理解决，均可干扰高级神经的正常活动，影响植物神经功能，进而引起胃肠道功能障碍。由于各人对外办刺激的耐受限度和反应方式不同，因此本症的类型和表现各异。暗示显然是重要的发病因素。此外，胃肠道器质性疾病痊愈后，少数可后遗胃肠道功能紊乱。 中医认为，七情郁结，思虑过度，会导致人体气血紊乱，气机失调，肝木克土，可引起肠胃功能的减退，而造成本病的发生。
消化系统疾病：比较常见的消化系统疾病如消化不良、胃炎、溃疡病、急性胃肠炎、便秘；
饮食因素：不规律的饮食习惯。
精神心理因素：对于成年女性、脑力劳动者、性格内向者、常处于神经过敏状态的人等胃肠道功能紊乱易感人群。
