1.所能判断病情的严重程度不一样。肝细胞发生炎症病变，谷丙转氨酶释放于血液循环中，而使血清谷丙转氨酶增高，提示肝细胞膜受到损伤；谷草转氨酶（高于正常值一倍以上在病毒性心肌炎中有诊断意义），当肝脏发生严重坏死或破坏时，谷草转氨酶的会显著升高，提示肝细胞损伤到了细胞器的水平。
2.主要存在的位置不一样。丙氨酸氨基转移酶广泛存在于人体各种组织、器官、肌肉骨骼中，以肝脏细胞的细胞浆中最多。谷草转氨酶主要存在于肝细胞的线粒体中。
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