1、由于是定性的方法也就是说只是给出阳性阴性的结果，而不能给出准确的数值。因此在用于判断其它疾病方面用定量检测血清HCG来代替。
2、由于检测者可能是取随机尿液检测，就有可能在妊娠早期出现假阴性的结果。
3、一些与HCG有相同或相适片断的激素可能会与尿试纸条上的抗体结合而造成假阳性。如黄体生成素(LH)、某些前列腺素、某些激素类避孕药
因此有需要的话可以用准确性和特异性更高的血HCG检测来代替，但有些影响因素也许是无法避免的。
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