有些军事试验基地被TNT炸药所污染。军火所产生的污水会污染地面水和地下水。这些被污染的水会呈粉红色，这是因为水被TNT炸药和黑索金所污染。这些污染物被称为“粉红水“，要清理程序十分困难和昂贵。
人长期暴露于三硝基甲苯会增加患贫血症和肝功能不正常的机会。注射了或吸入三硝基甲苯的动物亦发现会影响血液和肝脏，脾脏发大和其他有关免疫系统的坏影响。亦有证据证明了TNT炸药对男性的生殖功能有不良影响，而TNT炸药也被列为一种可能致癌物。进食TNT炸药会使尿液变黑。能引起亚急性中毒，慢性中毒。例如引起白内障，中毒性肝炎，还损坏造血系统，疑有致癌性。急性毒性：大鼠经口MLD700mg/kg，兔经口MLD500mg/kg，人在>2mg/m3环境中产生不悦感，并引起血液的轻度改变。人经口1mg/kg连续4日，未见血液方面改变。人的急性致死量估计为1-2g。
体内转归：参见硝基苯。
中毒机制：参见硝基苯。
