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JPS息肉通常在20-200个，可遍布整个胃肠道，最常见部位为结、直肠。肉眼观，息肉5-50mn，红色或棕色，呈圆形或椭圆形，多有蒂，表面糜烂或浅溃疡，切面呈囊状。显微镜下其特征性表现是囊性扩张的腺体衬有高的柱状上皮，固有层增生并有多种炎性细胞（如中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、淋巴细胞）浸润，上皮细胞多数发育良好。JP可存在局部不典型增生或呈癌前病变。文献报道JPS有两种显微镜病变型：JP内有不典型增生或腺瘤样增生区；JP和腺瘤性息肉同时存在。文献报道不典型增生最小年龄为3a.这些不典型增生改变可继发癌变。