分为0-苷、S-苷、N-苷和C-苷，这是最常见的苷类分类方式。其中最常见的是O-苷。
（1）0-苷：包括醇苷、酚苷、氰苷、酯苷和吲哚苷等。
（2）S-苷：是由苷元上的巯基与糖分子端基羟基脱水缩合而成的苷。医学教育网|收集整理如黑芥子中的黑芥子苷。
（3）N-苷：苷元上氮原子与糖上端基碳直接相连而成。如生物化学中经常遇到的腺苷和鸟苷等。存在于中药巴豆中的巴豆苷也为N-苷。
（4）C-苷：是由苷元中的碳原子直接与糖分子端基碳原子相连的苷类。碳苷在蒽衍生物及黄酮类化合物中最为常见，如芦荟苷。
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