1.胞外菌感染的免疫：多数细菌在感染机体后，仅存在于吞噬细胞外的体液或组织，中称为胞外菌感染，例如，化脓性球菌的感染等，并可引起吞噬菌细胞死亡和严重的临床症状。
2.胞内菌感染：胞内菌感染，系少数细菌，对人类致病的兼性胞内菌有结核分枝杆菌、麻风分枝杆菌、伤寒沙门菌、布氏杆菌、肺炎军团菌和李斯特菌等。专性胞内菌只能在细胞内生存，如立克次体和衣原体。在临床相当长的阶段内，吞噬细胞处于不完全吞噬状态，其清除主要依靠细胞免疫的作用。产外毒素的致病菌感染，在霍乱弧菌、白喉杆菌和破伤风杆菌等感染，一般仅在粘膜面或局部寄生，毒素入血而致病，不引起菌血症；而鼠疫杆菌感染，则可引起菌血症，甚至脓毒血症医|学教育网搜集整理。
因此，在临床微生物检查时，使用的方法是有区别的。胞外菌感染性疾病的恢复，主要依靠液免疫。毒血症的康复，主要依靠抗毒素免疫的治疗。
