对基因组学和生物信息学分析有兴趣,却不知从何学起?
对网上丰富的公共资源和数据库有兴趣,却不知如何使用和挖掘?
研究遗传疾病,拥有高通量测序数据,却找不到致病基因?
研究复杂疾病,拥有大量的样本、基因芯片数据,却无从着手?
检测到基因变异,却不知如何选择实验验证方案和解读?
为了满足广大医学科研工作者和基因检测解读从业者的急切需求,我们联合浙江大学和西湖高等研究院多位科研一线大咖隆重推出“疾病基因数据分析与解读研习班”,通过理论授课与上机实践相结合的方式,每人独享一台PC机和一个服务器账号,紧随大屏幕演示“跟我学”操作,以最短的时间掌握网上数据库和本地数据处理与解读的方法,通过四天的紧凑学习将为您打开基础医学研究的全新领域。本课程面向高校老师、临床医生、相关专业人员,特别适合已参加过浙江大学“基因组科学研习班”和“转录调控和R语言作图研习班”,具有一定基因组学概念的科研人员。
培训内容:复杂疾病数据分析、遗传病数据分析、肿瘤数据分析、常见数据库介绍、致病基因筛选、基因变异解读和验证。培训时间:2017年11月1至5日(1日为报到日,2日起上课)
培训对象:从事基因组医学相关研究的科研工作者、医生、教师、学生等。
培训地点:杭州东茂宾馆(杭州市凯旋路451号)
注册方式:
1. 培训费:4200元/人(开会议费发票,仅包含注册费、资料费、上机实践费、培训午餐)。
培训期间食宿自理,会务组可帮助预定。
2. 缴费方式:
账户名称:杭州本因生物科技有限公司
开户行:中国农业银行杭州玉泉支行
账号:19042101040021343
汇款用途处写明:姓名+上机号(由会务组在回执确认函中提供)
3. 非汇款学员可现场刷卡(含公务卡)或现金(含支付宝)交纳。
4. 会务组联系方式:
代成林 0571-88206579(固) 18757558672(移)daichenglin@zju.edu.cn
疾病基因数据分析与解读研习班课程表
日期 | 时间 | 内容安排 |
11月2日 (2017) |
08:30 ~ 11:30 | 基因组数据信息分析基础(王琳博士) 1. linux系统下的常用命令 2. emacs编辑器 3. shell脚本的编写 4. 常见序列格式介绍fasta、fastQ、sam/bam等 5. 常见注释格式vcf、bed、gff等 |
13:30 ~ 16:30 | 复杂疾病数据分析(郑厚峰教授) 1. 复杂疾病的研究现状及思路 2. 复杂疾病遗传关联分析 3. GWAS数据分析流程和案例 4. 关联分析软件Plink使用和文件格式 5. 基因型填充impute2和PCA |
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11月3日 (2017) |
08:30 ~ 11:30 | 遗传与基因组医学概述 1. 遗传与基因组医学 2. 遗传病类型和遗传模式 3. 致病基因的识别方法 4. 基因变异分类 5. 基因诊断 |
13:30 ~ 16:30 | 遗传病数据库使用介绍(丛培宽博士) 1. 常见的遗传病数据库 2. 基因变异频率数据库 3. 基因变异致病预测软件和剪接位点预测 4. 基因变异解读标准 5. 查询基因序列和引物设计 |
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11月4日 (2017) |
08:30 ~ 11:30 | 基因变异解读案例(俞萍副教授) 1. 经典遗传病案例介绍 2. 基因致病变异的解读 3. 致病变异的实验验证方案 4. 特殊的致病基因变异(重复碱基、同义变异、内含子内部变异、假基因) 5. 胚胎植入前遗传学筛选和诊断(PGS和PGD) |
13:30 ~ 16:30 | 遗传病高通量测序数据分析(孙昱副研究员) 1. 遗传病基因组研究现状及思路 2. 高通量测序样本选择方案 3. 外显子组测序数据分析流程 4. 基因变异的注释、过滤及致病基因的筛选 5. IGV工具的使用 |
11月5日 (2017) |
08:30 ~ 11:30 | 肿瘤数据库使用介绍(殷安博士) 1. TCGA数据库介绍、下载与分析 2. TCGA数据库应用经典案例 3. cBioPortal数据库数据库介绍与使用 4. Oncomine数据库介绍和数据分析 5. GEO数据库介绍与基因芯片出来 |
13:30 ~ 16:30 | 肿瘤高通量测序数据分析(莫凡研究员) 1. 肿瘤基因组研究现状和课题设计 2. 肿瘤全外显子组测序数据分析 3. 肿瘤转录组测序数据分析 4. 基因融合、基因表达分析 5. 可变剪切、结构变异分析 |