皖南医学院的学科建设：

根据2014年12月学校官网显示，该院有省级重点学科2个、省临床医学重点学科1个、省重点发展学科3个、省特色学科5个，设有一级学科硕士点3个、二级学科硕士点31个、专业硕士学位点1个。

省级重点学科：生理学、病原生物学；

省临床医学重点学科：药物临床；

省重点发展学科：消化内科、超声医学科、性医学科；

省特色专科：普通外科、神经内科、妇产科、神经外科、感染性疾病科；

一级学科硕士点：生物学、基础医学、临床医学；

二级学科硕士点：生理学、神经生物学、遗传学、生物化学与分子生物学、生物物理学、内科学、儿科学、神经病学、老年医学、皮肤病与性病学、临床检验诊断学、外科学、妇产科学医学教|育网搜集整理、耳鼻咽喉科学、眼科学、肿瘤学、麻醉学、急诊医学、重症护理学、人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、法医学、流行病与医学统计学、中西医结合基础、药理学、应用心理学等；

专业硕士学位点：临床医学专业硕士（内科学、儿科学、神经病学、老年医学、皮肤病与性病学、临床检验诊断学、影像医学与核医学、外科学、妇产科学、耳鼻咽喉科学、眼科学、肿瘤学、麻醉学、急诊医学、全科医学、临床病理学等16个领域）。