在中西医结合治疗发热和疼痛时，选择药物需要综合考虑病因、病机以及患者的具体情况。下面是一些基本原则：
1. 明确诊断：首先应明确发热和疼痛的原因。如果是感染引起的发热，需根据病原体的类型选用敏感抗生素；若为非感染性因素，则需针对具体原因进行处理。
2. 辨证施治：中医治疗强调辨证论治，即通过望闻问切等方法了解患者的整体状况，并据此确定治疗方法。例如，对于外感风热引起的发热头痛，可采用疏风清热的中药如银翘散；而对于气滞血瘀所致的疼痛，则宜选用活血化瘀的药物如桃红四物汤。
3. 西药与中成药联合使用：在某些情况下，可以将西药和中成药结合起来使用。比如，在使用解热镇痛类化学药品（如布洛芬）的同时，辅以具有清热解毒作用的中成药或草药煎剂，以增强疗效并减少副作用。
4. 个体化治疗：每个患者的身体状况不同，对药物的反应也会有所差异。因此，在选择药物时还应考虑患者的年龄、性别、体质等因素，并根据实际效果调整用药方案。
5. 注意药物相互作用及禁忌症：在中西医结合治疗过程中，还需注意避免可能存在的药物间相互作用，以及确保所选药物没有针对特定人群的禁忌症。

总之，中西医结合治疗发热疼痛时，应以科学严谨的态度，结合现代医学和传统中医的优势，为患者提供最合适的治疗方案。