原发性肝癌的主要辅助检查方法包括：
1. 血清甲胎蛋白（AFP）测定：这是诊断原发性肝癌最常用和最重要的血清学指标。大部分的原发性肝癌患者，尤其是肝细胞癌患者的AFP水平会升高。
2. 影像学检查：
   - 超声检查（US）：是一种无创、经济且方便的筛查工具，可以发现肝脏内的占位病变。
   - 计算机断层扫描（CT）：能够提供详细的肿瘤位置、大小及与周围组织的关系等信息，并有助于判断是否有远处转移。
   - 磁共振成像（MRI）：对软组织分辨率较高，对于某些难以通过CT确诊的病例有辅助作用。
   - 血管造影：可以显示肝内血管情况以及肿瘤血供特点，在部分情况下用于诊断或介入治疗前评估。
3. 肝脏穿刺活检：当上述检查不能明确诊断时，可通过细针抽吸或者组织活检获取病理学证据来确诊。
4. 其他实验室检测：如肝功能测试、凝血酶原时间等，这些可以帮助了解肝脏的功能状态和肿瘤对肝脏的影响程度。

以上各项检查需根据患者的具体情况选择使用，并结合临床表现综合分析以达到准确诊断的目的。