先天性甲状腺功能减低症，也称为克汀病或呆小病，是一种由于新生儿期甲状腺激素合成、分泌不足或者作用缺陷所导致的疾病。其主要病因包括：
1. 甲状腺发育不良或不全：这是最常见的原因，可能是因为胚胎时期甲状腺未能正常下降到颈部位置，或是因为甲状腺组织完全缺失、发育不全等。
2. 遗传因素：有部分病例与遗传有关，如先天性甲状腺激素合成障碍（例如碘有机化缺陷、过氧化物酶缺乏）、TSH受体基因突变导致的甲状腺抵抗综合症等。
3. 母亲因素：母亲在怀孕期间服用抗甲状腺药物或者自身免疫性疾病产生的抗体通过胎盘影响胎儿的甲状腺功能，也可能造成新生儿先天性甲状腺功能减低。
4. 碘摄入异常：碘是合成甲状腺激素的重要原料，如果孕妇严重缺碘或过量摄入含碘物质，则可能会影响胎儿的甲状腺功能。
5. 其他罕见原因：如垂体疾病导致促甲状腺激素（TSH）分泌不足等。
