诊断肠结核常用的辅助检查包括：
1. 影像学检查：腹部X线平片、钡餐或钡灌肠造影可以发现肠道的异常改变，如跳跃征、狭窄段等。CT和MRI对病变部位的定位及判断病变程度有较大帮助。
2. 内镜检查：结肠镜检查可以直接观察到肠道黏膜的变化，并可取活检进行病理学检查以明确诊断。对于疑似小肠受累者，还可以选择胶囊内镜或双气囊内镜等技术。
3. 痰液、粪便抗酸杆菌检测：如果患者同时存在肺结核或其他部位的活动性结核病灶时，可以通过痰涂片找抗酸杆菌或者培养来辅助诊断。此外，部分患者的粪便中也可检出抗酸杆菌。
4. 胸部影像学检查：由于肠结核常与肺结核并发，因此胸部X线或CT扫描也是必要的筛查手段之一。
5. 血液、腹水等其他体液的常规及生化指标检测：如血沉加快、C反应蛋白升高等非特异性炎症标志物升高可提示有活动性感染存在；若伴有腹膜炎表现，则需行腹穿抽液检查，以排除结核性腹膜炎。
6. 结核菌素试验（PPD）或γ-干扰素释放试验：用于筛查是否有结核分枝杆菌感染的可能。但需注意的是，这些免疫学检测结果受多种因素影响，并不能单独作为确诊依据。

以上各项检查综合应用，结合临床表现和流行病学资料，可以提高肠结核的确诊率。