真菌感染的部位不同所引起感染疾病的症状也不同。
1. 浅部真菌感染（外源性真菌）
手足癣、体癣、股癣、甲癣
2.条件致病性真菌感染（内源性真菌/机会致病性真菌）
如：白假丝酵母菌（白色念珠菌）引起的鹅口疮
3.深部真菌感染
新生（型）隐球菌：侵犯中枢神经系统引起慢性脑膜炎
4.真菌毒素的致病作用
急性中毒：毒蕈中毒，慢性真菌中毒：黄曲霉素、青霉素（霉变食物）
5. 真菌超敏反应性疾病
敏感患者吸入真菌孢子，引起Ⅰ型超敏反应。如：寻痲疹、哮喘、变应性鼻炎等。
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