胃酸在蛋白质的初步分解中起着重要作用。首先，胃酸的主要成分是盐酸，它能够将胃内的pH值降低到大约2左右，这个酸性环境对于激活胃蛋白酶原至关重要。胃蛋白酶原是由胃黏膜细胞产生的无活性前体，在酸性环境中可以转化为具有活性的胃蛋白酶。
其次，这种强酸性的环境有助于破坏食物中蛋白质分子之间的次级键（如氢键、离子键等），从而使蛋白质的空间结构发生改变或解体，这个过程称为变性。当蛋白质变性后，其内部原本被包裹起来的一些肽链暴露出来，为胃蛋白酶的作用提供了更多的接触面和作用位点。
最后，在酸性的条件下，某些特定的氨基酸残基会带上正电荷或者负电荷，这也有助于增强胃蛋白酶与底物之间的相互作用力，进一步促进蛋白质水解反应的发生。因此，胃酸通过创造一个适宜的化学环境来支持并加速了蛋白质的初步分解过程。
