在治疗过程中确保患者的自主权是非常重要的，这不仅体现了对患者的尊重，也是伦理和法律的要求。具体可以从以下几个方面来实现：
1. 充分告知：医生需要向患者提供充分的信息，包括病情、诊断依据、可能的治疗方案及其利弊、预期的效果以及可能出现的风险等，让患者能够基于准确的信息做出决定。
2. 尊重意愿：尊重患者的个人选择和价值观，在提供专业建议的同时，也要考虑患者本人对于生命质量的看法和个人偏好。如果患者拒绝某项治疗或希望尝试其他方法时，医生应当耐心倾听并给予适当的支持与指导。
3. 获得同意：在进行任何医疗操作之前，都必须获得患者的明确同意。这包括手术、药物使用以及其他任何形式的干预措施。当患者因疾病影响无法表达意愿时，则需要通过法定代理人或家属来代表其作出决策，并确保这些决定符合患者的最大利益。
4. 保护隐私：在整个治疗过程中，医生和医疗机构都有责任保护好患者的个人隐私信息，不泄露给无关人员，保障其尊严不受侵犯。
5. 提供支持：对于一些重大疾病或者复杂情况下的治疗选择，可以为患者提供心理咨询和社会工作服务等多方面的帮助和支持，协助他们更好地理解自身状况并作出合理的决策。

通过上述措施，可以在很大程度上保证患者在医疗过程中的自主权得到尊重和保障。