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一般来说，高分子化合物的成品无毒或毒性很小。其毒性主要取决于所含游离单体的量和助剂的种类。如脲醛树脂对皮肤的刺激作用大于酚醛树脂，是因其所含的游离单体甲醛较多之故。

高分子化合物生产中的职业中毒，多发生于单体制造，如氯乙烯、丙烯腈；对接触者可致急、慢性中毒，甚至引起职业性肿瘤。聚四氟乙烯生产中，通过二氟一氯甲烷( F22)高温裂解制取四氟乙烯单体时，裂解气和残液气组分中含有多种有机氟气体，其中八氟异丁烯为剧毒物质，可致接触者急性肺水肿。

除了在单体生产和聚合或缩聚过程中可接触各种助剂外，由于助剂与聚合物分子大多数只是机械结合，因此很容易从聚合物内部逐渐移行至表面，进而与人体接触或污染水和食物等，影响人体健康。

高分子化合物在燃烧过程中受到破坏，热分解时产生各种有毒气体，其中一氧化碳和缺氧是主要危害。

高分子化合物生产中某些化学物质的远期效应——致癌、致突变、致畸作用，值得引起重视。高分子化合物本身无毒或毒性很小。但某些高分子化合物粉尘，可致上呼吸道粘膜刺激症状。酚醛树脂、环氧树脂等对皮肤有原发性刺激或致敏作用。聚氯乙烯等高分子化合物粉尘对肺组织具有轻度致纤维化作用。

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