碘缺乏对人体健康的损害不仅可引起甲状腺肿，而且可导致脑组织发育受损、智力发育迟滞，体格发育障碍等。
（1）对甲状腺的影响：
缺碘使甲状腺素合成减少，血液中甲状腺素浓度降低，可反馈性促进垂体前叶分泌促甲状腺激素增多，长此以往，导致甲状腺增生肿大。此外，缺碘时，甲状腺对促甲状腺激素的敏感性增强，即使促甲状腺激素不增加，甲状腺也会增大。在早期，腺体增大属生理性代偿；中期，随着碘缺乏时间延长，细胞从增生过度到萎缩，碘不足产生的甲状腺球蛋白不能经水解分泌出去，致使大量胶质堆积在滤泡内。后期，胶质压迫滤泡上皮细胞，同时因血管减少，供血不足，使细胞变性坏死，局部出现纤维性结节或钙化。
（2）对脑组织的影响：
胚胎期至出生后两年是人脑发育的重要时期。妊娠早期缺碘，使甲状腺激素合成不足，甲状腺素缺乏可使胎儿大脑皮层、基底核以及内耳结构发育受损，造成出生后智力缺陷及耳聋。出生后继续缺碘，甲状腺素缺乏，此时会影响神经细胞树突、髓鞘形成和胶质细胞的发育，导致神经发育和智力障碍。
