显微镜下观察釉质龋磨片，最早显示为病损区的釉柱横纹和生长线变得明显。当釉质龋继续发展，釉质深层受累，病损区呈三角形，三角形的基底部向着釉质表面，顶部向着釉质牙本质界。在三角形龋损处，见淡棕黄色色素沉着，其边缘处颜色较深，病损区内呈现不同的层次，它反映了釉质不同的脱矿程度。
用光镜观察早期釉质龋磨片，其病损区由里向外一般可区分为四层结构，即透明层、暗层、病损体部和表层。
1.透明层：位于病损的前沿，和正常釉质相连，呈透明状，是龋损时最早发生的组织学改变。
2.暗层：紧接于透明层的表面，呈现结构混浊、模糊不清。
3.病损体部：是病损区范围最广的一层，从表层下一直延伸到靠近暗层。
提示病损体部脱矿最为严重。
4.表层：在龋损区表面有一相对完整的表层，表层有再矿化现象的存在。
以上各层次除病损体部外并不一定在每一个病损中都同时出现，龋损的结构变化受病损形成的速度和微环境因素的影响。其中透明层的出现率约为50%，暗层为85%～90%，而表层为90%。
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