衣原体镜检染色常用的方法有吉姆萨染色、碘染色和荧光抗体染色等，下面分别介绍：

吉姆萨染色是一种经典的染色方法。吉姆萨染料由天青、伊红组成。衣原体在吉姆萨染色后，其包涵体可被染成蓝色或暗紫色。该染色方法操作相对简便，它能够较好地显示出衣原体的形态特征，包括原体和始体。原体较小，呈紫红色，始体较大，呈蓝色。通过观察这些不同形态的衣原体结构，有助于在显微镜下识别衣原体感染情况。而且吉姆萨染色对标本的适用范围较广，对于细胞涂片、组织切片等都可以进行有效的染色，能在一定程度上满足临床检验对不同标本类型的检测需求。

碘染色也是检测衣原体的一种方法。由于衣原体的包涵体内含有糖原，碘可以与糖原结合形成棕褐色的复合物。在显微镜下，染成棕褐色的包涵体很容易被观察到。这种染色方法的优点是操作简单、成本较低，对于快速初步判断衣原体感染有一定的价值。但它的特异性相对有限，因为其他一些含有糖原的物质可能也会被碘染色，从而出现假阳性结果，所以通常需要结合其他检查方法进一步确诊。

荧光抗体染色是一种较为敏感和特异的方法。它利用荧光素标记的抗衣原体抗体与标本中的衣原体抗原结合，在荧光显微镜下，结合了荧光抗体的衣原体呈现出明亮的荧光。这种方法能够快速、准确地检测出衣原体，灵敏度高，能够检测到极少量的衣原体。而且它可以对衣原体进行分型，对于临床诊断和治疗方案的选择有重要的指导意义。不过，荧光抗体染色需要特定的荧光显微镜设备，成本相对较高，并且对操作人员的技术要求也比较高。

综上所述，不同的衣原体镜检染色方法各有优缺点，在临床检验中，需要根据实际情况选择合适的染色方法，有时还会结合多种方法以提高检测的准确性。