阿米巴包囊是溶组织内阿米巴生活史中的一个重要阶段，具有以下形态特点。

从大小来看，溶组织内阿米巴包囊呈圆球形，直径通常在10 - 20μm之间，这个大小范围是相对较为稳定的，在光学显微镜下，这样的大小使得其能够被较为清晰地观察到。

从结构方面来说，包囊具有一层透明的囊壁，这层囊壁比较坚韧，对包囊内部的结构起到保护作用，使其能够在外界环境中存活较长时间。未成熟包囊通常含有1 - 2个核，核的结构较为清晰，核仁细小，多位于核的中央。在未成熟包囊内还可见到糖原泡和拟染色体。糖原泡在染色后表现为一个较大的空泡状结构，它是包囊储存能量的一种形式。拟染色体则是由核糖核蛋白体组成，呈棒状，两端钝圆，具有鉴别虫种的重要意义。在溶组织内阿米巴包囊中，拟染色体的形态较为典型，其数目和形态会随着包囊的成熟程度而发生变化。

成熟包囊一般含有4个核，此时糖原泡和拟染色体多已消失。4个核的成熟包囊是感染阶段，当它被人吞食后，在肠道内会脱囊形成滋养体，从而引发病变。

与滋养体相比，包囊的形态相对稳定，不具有伪足等运动细胞器，这也使得它更适合在外界环境中生存和传播。通过对阿米巴包囊这些形态特点的准确掌握，在临床检验中，检验人员可以通过显微镜检查等方法，准确地识别和诊断阿米巴感染，为临床治疗提供重要依据。