卵子取出后，与精子在试管内共同孵育，每个卵子约需10万条精子。受精后，受精卵分裂形成早期胚胎，即2～8个分裂球时即可进行胚胎移植（ET），此时约在采卵后48小时，此时间也可根据具体情况稍加以变动，如推后一天，这时也可能更利于优选胚胎。
如果过早，宫腔内环境反而可能不利于接受胚胎。一般在刺激周期的前一周期，在门诊进行试验移植，以了解子宫的方位，子宫颈和子宫体间的角度及子官腔长度，并对子宫颈稍加扩张。移植时消毒外阴后，窥阴器暴露宫颈，擦净，再次用培养液擦子宫颈和穹窿及子宫颈管，将子宫颈管内粘液尽量去净。动作应尽量轻柔以减少对子宫肌肉的刺激。用特殊的移植管注入胚胎。进入宫腔，于距宫底0.5cm处注入胚胎，等待1分钟后，将头转动90°以甩掉未能滴下的一滴液体，再将导管缓慢撤出。导管取出后还要在显微镜下检查胚胎有未带出医学|教育网搜集整理。
移植后患者可以仰卧，臀部抬高，子宫很前屈者也可采取俯卧位，目的是使注入的胚胎停留在子宫腔的上方。静卧约3～6小时，可以排尿，避免尿液滞留。移植当日注射HCG5000国际单位及黄体酮30mg，以后常规每日注射黄体酮，如14天后尿HCG阴性即停止注射，妊娠者继续直到B超可见胎心后再逐步减量。对卵泡过多，可能致成卵巢过度刺激综合征者，不宜用HCG.
