不管以什么理由和用什么方法阉，阉割都会对男性健康造成极大的影响。开刀时的疼痛和丧失性能力自不必说，除此之外，阉割手术后，常常有人因为出血、消毒不好导致感染等原因死亡。古时土耳其人阉割男童作为内侍，据说死亡率甚至高达2/3，悲剧的是正因为死亡率高，所以活下来的就更显珍贵，能卖出更高的价钱。
就算没有死于手术，被阉割的人仍会面临很多健康上的问题。阉人们的骨骼会变得更加脆弱，年纪大了很容易驼背，这些都是女性患严重骨质疏松的表现。此外，阉人的乳房常常会发育异常，这是雄激素水平下降、雌激素水平上升的结果。
