甲状腺激素对于神经系统有非常重要的作用。神经细胞的正常发育与成熟有赖于甲状腺激素的作用。胚胎期至儿童期是神经系统生长发育的重要时期，如果在此期间甲状腺激素不足可以引起神经系统发育障碍，智力可以受到明显的影响。患儿表现出不同程度的呆傻，严重者连自己的生活都不能料理，轻者也不能像同龄儿童那样正常上学，学习成绩极差。
如果及时给予甲状腺激素治疗，可以避免呆傻，智力可以得到恢复和发展。成年人患甲状腺功能减退时，因其神经系统发育业已完成，对智力影响不大，只是表现反应迟钝，思维能力减低。
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