青蒿素（Artemisinin）口服吸收迅速完全，有首过消除，导致血药浓度较低。吸收后广泛分布于各组织中，也易透过血脑屏障进入脑组织，故对脑型疟有效。体内代谢快，有效血药浓度维持时间短。
青蒿素通过产生自由基，破坏疟原虫的生物膜、蛋白质等，使之死亡。本药高效、速效、低毒，对红细胞内期原虫有效，对间日疟和恶性疟，包括耐氯喹虫株均有强大而快速的杀灭作用，但对红外期疟原虫无效。因而主要用于控制症状。
临床用于控制间日疟和恶性疟的症状以及耐氯喹虫株的治疗，也用于治疗凶险型恶性疟如脑型疟和黄疸型疟疾。该药可以单用，但应用后复发率较高，与伯氨喹等合用可降低复发率。疟原虫可对青蒿素产生耐药性，医学|教育网搜集整理通过连续用药5～7日，或合用周效磺胺和乙胺嘧啶可抑制耐药性的发生。
本品在常规治疗剂量下安全性高，不良反应少。有消化道反应，偶见四肢麻木感、心动过速和血清门冬氨酸氨基转移酶增高。动物试验中发现有神经毒性、骨髓抑制、肝损害及胚胎毒性作用。
对青蒿素化学结构进行改造后，形成蒿甲醚、蒿乙醚、青蒿琥酯、双氢青蒿素等，均用于抗疟疾治疗。其疗效、不良反应等均与青蒿素相似。
